中药炮制机制研究是完善中药炮制工艺、制定饮片质量标准、提升中药临床疗效、丰富中药炮制理论、推动中药炮制学科发展的关键与核心基础。新世纪20年，众多科研工作者对中药炮制机制进行了深入研究，并在炮制过程中的化学成分转化、活性成分的体内过程变化、有毒中药炮制减毒规律、加辅料炮制增效减毒机制及生物医学新技术应用等方面取得了显著进展，初步阐明了多味中药炮制机制，极大地促进了中药炮制学科发展。纵观中药炮制机制发展，发现中药炮制机制研究逐渐将化学成分的体外转化与体内吸收、转运与代谢结合，将宏观机体生物效应与微观细胞、分子、靶点、通路结合，且更加注重从整体层面探究炮制机制，并初步形成了中药炮制机制现代系统研究体系。为进一步统筹推进中药炮制科学发展，笔者提出中药炮制机制研究需密切结合中药药性、重视疾病状态对药物作用方式及效应强度的影响、顺应中医药临床复方配伍用药的特点及充分利用系统生物学整体观的思路与建议，并进一步强调从传统中医药理论及中医药临床用药特点深入剖析中药炮制机制。